学术论文查重软件是一种通过比对文本相似度来检测抄袭和重复内容的工具。相比之下，知网系统是一个包含大量学术文献资源的平台。查重软件的优点在于可以快速、准确地检测文本相似度，帮助作者避免抄袭和重复；而知网系统则提供了丰富的学术资源，可以帮助研究者查找相关文献。然而，查重软件可能存在漏报和误报的情况，而知网系统的文献覆盖范围可能会受限于订阅范围。

在实际应用中，学术论文查重软件和知网系统可以结合使用，以达到更全面的效果。作者可以先使用查重软件自行查重，再通过知网系统查找相关文献进行参考。这样可以有效避免抄袭和重复，并且获取到更多的学术资源。综合来看，两者各有优劣，根据具体需求选择合适的工具是最重要的。